Danh Sách 69 Chỉ Thị Ssr Sử Dụng Để Phát Triển Gen Bố Mẹ Và Quần Thể F2

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
179	CMTm230	GGATGCCATATATCTGAATCCTG	CGAAATACCGCTGCAAAAG	55	119-130
180	CMTp97	CCACACACCAATCGTTGAAG	CGCAGAATCTCGAAACACAA	54	163-169
181	CMTp130	GCCCATTTCTGGAGAGATAGTA	GAGGAGAGATGCAGAGCAAC	55	164-172
182	CMTp169	TGCAGTGAATGGAAACCTGT	TCCGGCATTATAATCAGAACC	59	153-161
183	CMTp225	CCATCTTTCCACCCTCAATG	AGCTGAAGTGCCTTCTTGGA	50	146-156
184	CMTp38	AGGATTTCAGGTATGGTCGTG	AGACGTTCCCTCCCCTCT	56	160
185	CMTp61	AAGGGTTCGTCGGAGAAACT	CAACGACTCCCAGCACCTAT	56	118
186	CMTp74	ACCCCTCTTGTTCTTCAAGG	TTACTCCCATTTTCCCCATT	58	184
187	CMTp75	TGGGGAAAATGGGAGTAAGAG	TGCTTGCGTTGGCTTACATA	56	118
188	CMTp76	TGAAACAGTCATCTCTTTTGTTGA	TCTCTGGGTGTGTTTCTTGC	46	175
189	CMTmC73	TTTTCACACCGAATGAGCTTG	GCCCACTAATTCTAGGGTTTGC	45	215
190	CMTmC66	TCAACCCAACATTTCTCTCC	AGAAGAGGCTGAGGAGTCG	59	175
191	CMTmC65	ACAGAGCATGATCCAACCTG	CCATTGGGCAGATCCTTC	55	171
192	CMTmC58	TGAATTCTCCTTCCCCTCGT	CCCTCCGAAGAAAGAGAAGC	54	100
193	CMTmC57	AACTAGGGTTGTGTCTTAGAAAAATCA	TGATGATGCTAATGATGTTAATGATG	55	185
194	CMTp5	GGGTCTATCTCTGTGTTGACTGG	AGGACGCATGGAGTAGCAAT	55	178
195	CMTmC50	CAGGGGCTCTGATCTGAAAG	TTTGATGCATCTCTTGGAAGG	60	132
196	CMTmC47	GAGATTCGGTTCAGGCAATG	CTGGCTGGCTTCGCTACTT	57	122

Có thể bạn quan tâm!

Danh Sách Chỉ Thị Adn Sử Dụng Trong Nghiên Cứu ( 300 Chỉ Thị Định Vị Trên Hệ Gen Bí Đỏ).
Danh Sách 300 Chỉ Thị Adn Định Vị Trên Hệ Gen Bí Đỏ Sử Dụng Trong Nghiên Cứu
Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử phục vụ chọn tạo giống bí đỏ Cucurbita spp. có hàm lượng chất khô cao - 19
Kết Quả Đánh Giá Một Số Đặc Điểm Nông Sinh Học Chính Của Các Mẫu Giống Bí Đỏ
Kết Quả Chạy Phần Mềm Mapmaker/exp V.3.0B
Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử phục vụ chọn tạo giống bí đỏ Cucurbita spp. có hàm lượng chất khô cao - 23

Xem toàn bộ 201 trang tài liệu này.

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
197	CMTp221	CAAACTCTTTCTTCATGGAACG	TGAAACTCAGCGAAAACTCG	56	111
198	CMTp132	CCATTTCCATTTCCATTTCA	AGGTTAGAAACAGGGGGAATC	46	151
199	CMTm233	CCCTTCTCGCTGATTTCAAG	CAGCGCAACAGCATTACATC	59	136
200	CMTmC15	TATGTAGCGCTCTGCACAAT	CCTCAATGTAATGTTTTGAATCC	55	113
201	CMTp188	CCGAAGGTTAGCAGACCCTTA	AAGGACCTCATGCATTTTGC	47	147
202	CMTmC21	GTTTTCCCGAGGAAGAGGAG	ACCTTATATTCTGGTCTGCCACA	55	112
203	CMTp18	TGACATCACTCCGGCAACTC	ACACCTTCGCTTCCGACATC	51	158
204	CMTm187	ATCGGTGAGTCCCAAAAATG	ATCACAAAGCGGGAAAACAC	52	128
205	CMTm49	TCCCCATTCATTCATTCATC	GGAATCTGAGGCTTTTGAGG	50	100
206	CMTp133	TGCTCTCTTTGAATTCAGCAT	AGGGATCTTCCATTTCCAAT	56	113
207	CMTm158	CCCAGCTATGAAGGTCTCTG	AAAAGCACAAAAGAAACACCA	55	80
208	CMTp125	CTTGTTCCGCAGCATCAG	AGTGAGAGGGAGACGCAAAG	55	115
209	CMTp127	TTCCTCTGTTTCCGTCAATG	CACAAAAGGGGTTTGAGGTT	55	112
210	CMTp107	CGATGATGAACAGGAAGACG	TCACATCCATTCCCCTCTCT	59	109
211	CMTp158	CCGTAGAGATGTCAGAGACAAGG	AGGGATGCTCATCACACCTC	45	134
212	CMTm259	ATGGAGACGCGCAAGTAGAT	ACCTCGAGGAAGCAAAAATG	56	169
213	CMTp176	CCTGGACTTCCACATCAGTT	ACTACGTGTCTCTGCAGGAAG	58	111
214	CMTp33	AATGCGTTTGAACAAAGCTG	GGCTGTTAAAATTTCCTCGATT	46	171

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
215	CMTm65	GAACTTCGTGTGTGCGTGTC	TTGCTGGAACTTCCTCTCGT	57	97
216	CMTp69	ATACTTGCTCCCCAAGTTTA	AAATAAAAAGACAACGTAATGGT	60	70
217	CMTp68	CACACCCATTTCATTTTGACC	ATTGATTGGGACGTGAGGAA	47	189
218	CMTp36	ATTGATTGGGACGTGAGGAA	TTCAGCTTCCCGGATTATGG	59	151
219	CMTm111	CTCCATTCCCATGGCTTC	CCATGAGCTTGAGAGAGGTG	46	110
220	CMTp145	ACAGCCCCATTTCTTACCG	TCAAGAACTGAGGGGATTGG	51	100
221	CMTp138	AAAGGTTTCCACATCCTTG	GAAAAGGAAAAAGTGTTCAAAG	59	103
222	CMTm221	CAATAAGATAGCTCTCACGTTGC	TGCCTAGTTATCGCGACTTC	46	108
223	CMTm183	CTTTGCATTGCCACTCTTCT	TGAGGGAAATTGAATGTGGT	60	115
224	CMTmC14	AAGCCGTGATGGACAACATT	CCACCACCCCTGATTTTAACT	59	129
225	CMTm66	ACGCGTTGTTGTTAGTGTGG	GGGGATTTATGAACCCAACAT	45	126
226	CMTm9	GCCCAGAAGACAAAAGTTCG	TTTTTGTGTGCGTGTGTGG	58	158
227	CMTp248	GATCGAATTGGGGCTTCTT	CCTCCGTACATCCCCAGA	53	154
228	CMTm170	TCAGACCCACTCCCATGAAC	AGCGAACACGTGAAAACGTC	58	113
229	CMTm130	CCCTCCACCACCTCCTTAG	CAGGGGGATCATAAAAGTGG	55	110
230	CMTm172	CATTGGAGTGCGTGAAATTG	GTGAGTGGTCAAAGGGCATT	59	115
231	CMTp63	CTTCGTCGACACCAATTCC	GAAGACGAAGATGACGTGGA	56	152
232	CMTm107	ACAAATGCCATGAAACACAACA	TGGTTGCTAGAGACCGTTGG	55	127

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
233	CMTp201	AGGAGTGGTGGGCTAATACG	TGAAATTGAGGGAGGGAGAG	48	110
234	CMTm30	AGGTCCATATTTGACG	CAAACCATAACTTCCAG	55	161
235	CMTm11	TGGAAGGATTCTCCCACAGT	TACAATTTGACGTCCGCAAG	52	158
236	CMTmC67	ACATGTGGGTGCAATGAGG	CACCATTGTGGAAAATGAAACA	47	114
237	CMTm120	GCCAAAGGTTCCAAATGACA	TGATTTGCGCACAaACAAAC	56	121
238	CMTm126	TTTCATGTTATGATATTGTCAG	TCCAAAGCTTACGTTTACT	57	159
239	CMTmC34	CGACGAATCTTTTGCTCCTC	CTCAAATCCTCCCTCACTCG	50	107
240	CMTm131	TAGAGTTCGATCAATGCAA	GTTGATACTTCAACCACGTT	60	111
241	CMTm144	ACATGGGCATACCTCGAATC	CACCTGGCTGTTTTGTCTGA	59	150
242	CMTm206	AGGAACGGAGGGATAGAAAAGA	CCTTGTCCCCAAGTTGCATA	58	171
243	CMTm207	GGAAGAGAGAGATTGTAAGCACA	CCCTACACAACAGTGGCTCT	52	108
244	CMTm209	ATTAGAATCCCTTGGAGAACG	GCAATCGTTTTTCTGTTGGT	57	152
245	CMTm219	TTCAGAGGACATCTGCCATT	ATAGTTCTCGCTGGGCTTG	58	112
246	CMTm224	GTGGGTCGCTCCTTAAA	ATAGCGGATAAAGTGGACTG	52	120
247	CMTm252	CCCATTCCCCATTTCTTTCT	CAAATTCGATCGGCTTTACAC	59	101
248	CMTm261	GGTGGCCTCTGAACAATTTC	ACCTAACCAATGGGCATGAG	55	228
249	CMTm84	TATCACCAAACGTGCAT	AGGTTTTGAAGAACAAATTC	57	122
250	CMTm68	CGCCATCGTTGTTCTTCAC	AGATCCACAGCGATTTCGTC	47	109

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
251	CMTm83	GGCATTTCTGAGAACAGCTT	ACGTTAGTTATGCTATTTTGTAGGC	55	111
252	CMTp182	CACGAAGATTTGATGGCCTTA	GGATTGGGATGGTGAAGATG	50	138
253	CMTp174	GCCGGAACCAGACTTCTC	CCCTCCCTTCCCATTAAAC	45	176
254	CMTp210	GTGGAAGTTACTGCGATTGG	GCAAAGAATGTCCTCAGCAG	50	117
255	CMTp247	GGGTGTGTTGAGGATTGGTT	ATCACATTTTCTCCCCACCA	56	123
256	CMTp46	TTCCCTTCTGCAGAGATGC T	CCATGCGCATAATTGTATCG	59	142
257	CMTp233	TTTCAAACGAGCACAAGCAC	GTTGCTCCAACTCGATCTTCA	60	104
258	CMTp236	CACATGCAATGAAATGATGG	AATTACCCGTTGAGACAGCA	55	82
259	CMTp241	ATCCACAAACAAGGCACCTC	GTAGTGGAGGCTCGGGTGTA	48	110
260	CMTp243	ATTCCGACTTGGGGATACCT	TGTCCTATCGCTTCGGAGAT	45	158
261	CMTp253	AGGTTGTGGAGGGTTTACTGG	ACAACAGGCCCAGAAACAAG	55	139
262	CMTp258	GGGCTACTTCCCCTAAAGATG	ACGATGCGTATTCACACTCAA	45	231
263	CMTp261	AAATGCCAGCCCAAATCAT	GATGGCTGCCACTTCCTCTA	46	187
264	CMTm17	CCTCTTTCAGGATTTCATTCAT	ACAAGCGATTATCTTACCGAGT	55	113
265	CMTm20	GTGGGCCATATCGATTCACT	CGAAAGTCGCAGAGAACACA	57	126
266	CMTm23	TGTATGGGGGAGTATTTTGG	TCAAGTCAACGAGTATCGTCAT	55	103
267	CMTm77	AACACTCGGCCACAACATC	CTCCTTGTAAAACGGGTTGC	59	189
268	CMTp48	TTTGCAGTACGCTGCAGAAC	GGATCCTTCTCGTGGTGGTA	55	228

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
269	comp11018	GGGAGGCTACGAAGGAAAAG	CAATGGGGAAGTGGTAGGTG	55	nd
270	comp13350	GGACGAGGAGGTTTCAACAA	AAGGAAGCAAGAACACTCGG	56	nd
271	comp27618	TGAGCAGACCCTTGTTTTCC	GGTTGATGGGTGGAACTTTG	55	nd
272	comp28857	GACCAACCTCTTTCCCATCA	AAGGCGTAATAGCAGCTCCA	47	nd
273	comp40082	GGTGGTCCGGCTATCAACTA	TGACAGGGGATGAAAGGAAC	56	nd
274	comp41315	TTTGAAGTTGTTGTGCGGTG	ACTGTTGGCCGGTAGATTTG	57	nd
275	comp52235	GCCGATTGTTGAATATTTCG	TCATTGAGAGGGAGTCCCATA	50	nd
276	comp52664	CACTGTTTGGCAACGGTTTA	GATCCATGTGACAACCATGC	45	nd
277	comp64835	GTGGAGATCGTTGAAGGGAA	GAGCTTTCCACTCAGGCAAC	58	nd
278	comp66738	CGCCTTCATTGCAACATAAA	AGTGAGGGAAAGCAAAGCAA	56	nd
279	comp71199	CTGGGCACACTAGGGTCAAT	TTTATGCCGAGCAAACCAAT	57	nd
280	comp71344	GCTCTGGAGGATGAAACTCG	GGCTAACCCAGAAGGAAAGG	60	nd
281	comp71363	TGATGAGATTGAGAGCGGTG	AAGTGAATCCTTTCCGCCTT	48	nd
282	comp71542	AAATGCTCCTACCGAAGGGT	CAGCTTGAACATGATGCCAC	56	nd
283	comp72289	TGGTTGCTCATTGTCTTGCT	ATGCGCTATTTGCTTTCTCC	46	nd
284	comp72586	ATCACCACCGCAGGAACTAC	GGGCATCCCAACCTTTTATT	58	nd
285	CMTm89	ATAGGAATGTGCAGAGCTGAG	CAATATAGATACCGTTTTTCGAATC	56	nd
286	CMTmC1	AACGTCCTTACTGGCACACC	TTCCACAAGTTGTTTTGGTCAC	59	nd

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
287	CMTmC60	ATCAGGCTAAGGCCCAAACT	GCCAATGTAATCTCCCCACA	55	nd
288	CMTm13	AAGCTCCCCAGAAACACAAT	ATTGGGGTCAGAATGAAGGT	46	nd
289	CMTm14	TCTGCTGTCTTCATCTTTGCT	CCAGCAGACAAGCTAATGTGT	55	nd
290	CMTm248	TGATCATGAAAGGGGGAGAG	CCACTTCAAGCTTGCCTTCT	46	nd
291	PU025208	ACAGCAGACTTTGCGAGCTT	AGAGAACCGGAAACCCAAGT	55	nd
292	PU002959	TGAGCAGTCAATATCAACCAAAA	GAGGATTGAAGGCCATGAGA	48	nd
293	comp98739	ATGCACGGTTGCTTGAAACT	CCAAGCAAAATATCCGCCTA	56	nd
294	PU026252	GTCCCTTTGTTGAGCAAGGA	CTTCCAATCGGAAATGGCTA	56	nd
295	PU024278	GGATTTGAGAGCAACCCAGA	CCCCTTTTCCCTCTCTTTTG	60	nd
296	H39	CGTTTTCACAAAACCCTCGT	GAGAAGAGCAACGCTTTCGT	57	nd
297	H41	TAGGTTCAACTCTCTCCCCG	TACTGGTTTTTCCAATCCGC	59	nd
298	H65	ATCATAGTCGTCGTCGGGTC	GCCGATTCTTGAGGAACAGA	55	nd
299	CMTp37	GTCTGGTCTTGGGGTGGTTC	AGAAACAAAGTGGCGGGTGT	53	nd
300	CMTp57	GCCGTCAACACCAAACTCC	AGCGCTGACGGAGGTTAAAT	55	nd

Phụ lục 5. Danh sách 69 chỉ thị SSR sử dụng để phát triển gen bố mẹ và quần thể F2 trong nghiên cứu

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
1	CMTp231	TCTGGTCTTGGGGTGGTTCT	AGAAACAAAGTGGCGGGTGT	59	170
2	CMTm48	AAGCCTTTGGGGACCTTTAC	TTGAAACCTTCAAACAAGAAATTG	55	100-120
3	CMTm88	CATCGACATTCGCCTCATC	AGGCAGCTTCCAAATCAGC	54	108-134
4	CMTm188	ACTGAGAGGCCCTGAATTGT	CCCCCTCTTAGTCTTAATATTCTCA	60	158
5	CMTp177	AGCCAAACCAGCATCGAAAT	CGACGATGTCAAACCTCCAC	50	194
6	CMTp224	CACCGACGACTCCATCATC	CTTCTTGTCCCCAAAATCACA	56	155 173
7	CMTp26	GTCTTGGTCTTGGGGTGGTT	AAACAAAGTGGCGGGTGTC	60	187
8	CMTm192	CCAATGCTTTGACAACAACCT	GAAGGAACGGGCATAAGTGA	58	100-120
9	CMTmC62	TGGATCCTCACTCTCAACTCA	GAAGAGTTACTACGTTGCTAGCCTAT	55	140-160
10	CMTp252	TCTCACTCATCCACCACACC	CGTTTCGAGTCATTTGTTCG	47	175 - 208
11	CMTp39	GGCGAAAAGGAAGAACGAAT	TTTTTCTCCCCCTTCCACAT	56	132
12	CMTm10	TGTCTTCGACTGCAAATCCA	CGTCAGGGAGAGGTTTTCAC	55	125
13	CMTm222	GCCGTTTTCTCTCTAGGATGC	TAGGTCCCTGATTCCCTCGT	53	131-139
14	CMTmC61	TTATTGTCGTCGCTCTGCAC	TCCGGAACTATTATAACAACGACA	60	162
15	CMTmC22	TCGAAGTACGTGATGGGACTT	CCATTATGATAAAGCTCCGTTGT	56	155
16	CMTm255	CGCTTCCTTCCTTCTTGGATT	CCACTGTTGTGTAGGGGAAGC	58	91

Xem toàn bộ nội dung bài viết ᛨ