Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử phục vụ chọn tạo giống bí đỏ Cucurbita spp. có hàm lượng chất khô cao

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
35	CMTm54	GTGTGGATGCAAATGGTGAG	GGGAATCGAGGGTTTTGAAT	59	120-141
36	CMTp129	CTCTTGCTCATCTTCCTTGTTG	CCCACCCATTTACCCTCTAGT	54	147
37	CMTp77	GGCCATATACGAGGTCAGGTT	TTAGCGATTCAACGGAGGTC	56	102
38	CMTp62	GTGCCCGTCAGTCGGAAT	TGTCGACGAAGATAGCAATAGCA	57	134
39	CMTp26	GTCTTGGTCTTGGGGTGGTT	AAACAAAGTGGCGGGTGTC	60	187
40	PKCT-47	GGTCCCAATAATAGCAACCAA	GTGGGACACATCTTGAGCA	50	205-269
41	PKCT-111	GTT GCA GCG ACC GTT CTT CTT C	GCA TCT GAA GAC GAT GCG TCG T	56	187-210
42	PKCT-122	CTA AAC AGG ATG CCT CTG ACA C	CGG GAT TTC CGA AAC AAC GT	60	181-225
43	CMTm227	ACTTAGTTGAAAACAACAATTTACCA	TTCTCTCCCAGATTCTAGTTGC	59	209
44	CMTm223	ACAAATCCATGGACATTGAGC	ATTACCGAAGCAAGCACGAT	57	131
45	CMTm29	AGCGCAGCGACAGAAAAG	AGCTTCTACGAAGGCGAGGT	60	91
46	CMTp17	ACTGCTCAATAAGGCAAGGA	AAACAAGAGTGCACAAACAGG	45	70-90
47	CMTm61	GCCATTATTCCACTCCATGC	TGCCTGCACCTGTTTTAGC	52	120-156
48	CMTm192	CCAATGCTTTGACAACAACCT	GAAGGAACGGGCATAAGTGA	58	100-120
49	CMTm232	AGAAAGAAATAAGGAACCCACAG	CGTCTCGCAATTCTTCAACT	59	150-180
50	CMTm239	CAAAGATCTGTTGTGTCAGAGT	GGAGAGTGGAGGAGGTAGAT	57	180-200
51	CMTmC62	TGGATCCTCACTCTCAACTCA	GAAGAGTTACTACGTTGCTAGCCTAT	55	140-160
52	CMTm118	CACTTCACGGACTCCCTTGT	CAGCAGAAGTGCGAAGACAG	56	120-140

Có thể bạn quan tâm!

Xem toàn bộ 201 trang tài liệu này.

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
53	CMTp249	GCAATCATTAAGGAATGGCACT	CCGACCCATGGATCTTATCTT	55	160-190
54	CMTp252	TCTCACTCATCCACCACACC	CGTTTCGAGTCATTTGTTCG	47	175 - 208
55	CMTm37	CGTGTTTGTGTTGGAAAAGC	AAGCAAACCCACAGAAGGAG	57	13-160
56	CMTm63	GCAGAAGATACCGTCGGAGT	AAGGTGAACGGGAATGTGAG	60	119-139
57	PU000705	AAAGAAAAGCTCGCTTGGTG	TCCATGCCCACATCAACTAA	56	122
58	PU002147	GCTCTGTGAAGGAGGACGAC	CCGCTGCATAGGGAATGTAT	59	239
59	CMTp178	GAACATTTCTGGTTCAATC	CTTTCAAAGAAGCGTAAAG	58	132
60	CMTp202	GTAAGGCGTGGTTGGAAGC	GTTCCCTTTCCCCCTTTGTA	51	156
61	CMTp39	GGCGAAAAGGAAGAACGAAT	TTTTTCTCCCCCTTCCACAT	56	132
62	CMTp229	GATCCTACACGCCGTTTGAT	TCATGACCTCGTCACTCTCG	60	103
63	CMTm10	TGTCTTCGACTGCAAATCCA	CGTCAGGGAGAGGTTTTCAC	55	125
64	CMTm97	AGGGGGAACTGATAGTCATCG	ACCTCACCTTCCATCGTCAC	54	164
65	CMTm222	GCCGTTTTCTCTCTAGGATGC	TAGGTCCCTGATTCCCTCGT	53	131-139
66	CMTp203	GGAATTCCATCTCCGAGTCA	GCATCCTTCCAAAACAAACTTC	55	180-197
67	CMTp21	TGTCCAATTCTTCATTGCTCA	GGATTCCACCACAATTTGAGA	45	201
68	CMTp260	CCCTAGACCCATCATAGTCG	ACATTTGGTTACTTCCCCATT	57	155
69	PKCT-133	TCG GAA TCG TCT TCA GCA ATA GTC	TCC TCT TCC ATT CCA CTT TCT CCT	50	201-251
70	CMTmC61	TTATTGTCGTCGCTCTGCAC	TCCGGAACTATTATAACAACGACA	60	162

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
71	CMTmC52	GTTACGATTTTCATTCTGTCCTG	ACGAATACAAAGTTTTCTCTCTCC	54	151
72	CMTmC37	TCCACACTCAGCTACCACCA	GAAAAGGCAAATGGGGAATC	59	110
73	CMTmC36	TCAAAACGGTAGGAACTTCACA	GCGATGTTTATAGCTTCGGAGT	58	169
74	CMTmC32	CCGCCACCACTGAACAACT	GGCTGTGGCCCTCCATAGT	56	113
75	CMTmC27	AAAGGAACATCAAAATGGTTGC	AGCTTTCAGCTTGCTTTCCA	51	106
76	CMTmC26	TTGAAGCACTGGAAGCCATT	GGAAGGAAGGGGAGAGTGAA	47	173
77	CMTmC22	TCGAAGTACGTGATGGGACTT	CCATTATGATAAAGCTCCGTTGT	56	155
78	CMTm255	CGCTTCCTTCCTTCTTGGATT	CCACTGTTGTGTAGGGGAAGC	58	91
79	CMTm253	GCAACAAATTGTAGTTGCAAAG	GCCAAAGGTTCCAAATGAC	60	155
80	CMTm249	CATCATCAATCGAATAGATTTCATC	GAAAACTCCCTCGTTTACGC	57	164
81	CMTm243	GACAGGACAGGTCAACACCTC	AACCCAATTGCACAGCTTCT	51	139
82	CMTm235	AATCAGGTAGCCAACACCTA	AGACCATTCATAATCAGATCCT	56	107
83	CMTm217	CCCGCTAGCATCACTCATC	TGGGTTCAAAACAAAACGAA	54	92
84	CMTm176	TGCTTTTGGCTTTACCTCTC	CGAGATTTGCATCTTTCGAT	45	128
85	CMTm175	GAGTGATGTTTTGAGTAAACAG	CTTGTTCATCATCATCTGTG	55	94
86	CMTm172	CATTGGAGTGCGTGAAATTG	GTGAGTGGTCAAAGGGCATT	56	115
87	CMTm165	TTCCAGACCCAATTCCCTTA	TCCATGGAGATGGGAGGTAG	59	126
88	CMTp131	GCACTTGAATCTTCGTCAAC	CGAGAAAGAATTAACGAGCA	55	117

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
89	CMTp208	CGTGAACATTCGTTTGTTGG	TCATCCGTTTCCTTTTCAGC	50	120-140
90	CMTmC43	CGAGTAAATCGCCTAACACC	GGGAATTTGTAAATCTTCTCCTC	60	120-130
91	CMTp19	AGGAGGGGAAAATACAGAGT	GCCACTATAAATCCACCACT	55	110-130
92	CMTp32	TCTCTCCAGAGAGTTGCAGGT	AATATCCACCGTCCGATCAT	47	130-140
93	CMTm134	TGCCTTCCTTCCCTGATCTA	ATCAATCAGCTGTGCGTTTG	47	170-180
94	CMTp223	TCCTGTTGAAACCTGAGAAGA	AGGTTTGGGGAATTCAAGAT	60	160-180
95	CMTm87	AATCTGCAAACGGACTTCAAT	TCACAGTGATCCCCAAACTC	56	96-102
96	PU000007	GGAGACCCCATTTTCCTGTT	AAGCACTCACTTCCCCTTCA	58	105
97	PU000308	GGGGGAAGCCATTTATTCTC	CCATGGCCTTACAAGAAGGA	60	194
98	PU000750	AAAGTTGTCCAAAACCGACG	GGCTCGAGAATCTGAAAACG	56	228
99	PU001491	CACAGACGCAGAAACAGAGG	AAGGACAAGATCCATGGGG	45	158
100	PU001551	AAGGAGGAGGAGGTAGCAGC	CCTCGCACTGAGACAACAAA	51	161
101	PU001869	TCCGGTAGAGAATCATTCCG	ATCATCCATCATCGACCCAT	52	177
102	CMTp141	ATTCATGTCATACTACCGACTTC	CGGATTTATAAGATGGCAAG	56	135
103	CMTp53	ACAACCATCACAACGCTTTC	TTGGAATCAGTTCCAGTTCG	60	120
104	CMTp106	ACCCTAAGCCAGATATTCATGC	GGGCTTCATGCATCTAGTTTG	46	153
105	CMTm62	AGTGAGGGAGGCGACAACT	GAACGTGTCCATGTCATTGC	55	100
106	CMTm130	CCCTCCACCACCTCCTTAG	CAGGGGGATCATAAAAGTGG	60	110

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
107	CMTm25	TGAAGCTTTCAGAAATGAATGTG	CTGACGTCGCTACTCATAGCA	60	158
108	CMTp41	TTCTCTCAACCACCGTCACC	GGAGGCCTTGGAATGATAGG	55	141
109	CMTm47	TCCATTCCCAGATTTGAACG	CAGAGCCCACCTAACAGCAG	45	143
110	CMTm155	ACTTGCGGACTTTCACACCT	TGAAATGAACGCAGAATTGC	55	137-144
111	CMTm247	CCAAAATTCACTAGAAGTAACGATCA	ATGCAACGAAGTTGGGGTAG	56	120-137
112	CMTp144	ATGGCTTCCAAGCTCCTCTT	GTCGGCCATGAGCTTGAG	45	103-118
113	CMTp121	CCCAACCCGTCTCATAAACA	TTTAGGCCCAATGTTCTTGCT	59	217
114	CMTp239	ATCTCGGTAAAGCTCCGTTC	TATGGTTCTGCCTCCACAAT	56	101
115	CMTp264	TGTCCATAGTCGAACGTCCA	CCCATTTGTGATGATGAGTACG	60	104
116	PKCT-62	GAA GTT CGT GGT CTG TGC AAG TC	CCT GAG TAA CCT CCG TGC TTC C	60	300-326
117	CMTmC70	CAGGCTATTCGCACCCTCTA	CCTCATGCATTTTGCGTGTA	58	196
118	CMTmC69	AGGCAGTGATATAACCATGAAATG	TCATAACATAACATATCGCATCACA	56	188
119	CMTmC63	CAAATGAAAGAGTTTAAGCTTCAGTG	ATGCCTGCATTTCCAGAGTT	57	91
120	CMTmC56	GGGCTCTCTCAACCTCACTC	CCGGGAATGAAACAAACAC	60	179
121	CMTmC55	GTCATCTCATCATCATGCATCT	AATGTTATATGATGTTACACGATGG	54	113
122	CMTmC53	GAGGCGAAAATGATCAAACAG	CATCACGTTCATTGGCATTC	56	196
123	CMTmC51	CCTCAACAAATTCCTCCATTG	CTCCAATATCACCGAGAGTCG	45	118
124	CMTmC46	TATGAAGTGTCGTCGGTTCG	CAGTGTTTGATGCAGCCATT	59	134

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
125	CMTmC44	ACCTTCCTCCTCCGTAATGT	GACGAAGCCAACAACTACAAC	55	112
126	CMTmC42	TCACAAAGTCAAAACAGACAAACA	TGTTTCAGGGAAATGAAGAGG	56	105
127	CMTmC41	TCCCTTCCAACCAAGTAAGC	CCTAACCTGGTATTGTTTATGATCC	47	107
128	CMTmC40	CTCCTACGTAAGGGCTGTGTG	GCAATGAAATGATGGGACCT	55	135
129	CMTmC38	TGTTCATAATATTACATTTTCTTCGTC	AATTAGGGATTGAATTGAAATGAT	59	153
130	CMTmC35	CACGCCTCTGATTCTCAACA	GTTTCCATTGATGGGGTTGT	60	109
131	CMTmC33	TCGTTGTTGTAGCCTTTTTGC	AAGCGAGGAAGAGAGGTTTTG	56	105
132	CMTmC31	GGGCAACACCACAAATGAAC	GATGCCTCCACCATCGAGTA	50	113
133	CMTmC28	GGTCAAATTCAAGGGCTTACC	AGGAGCATCCTTGTCGTTGT	58	111
134	CMTmC20	GAGACGTTTGGCTTTTCTTG	AAGAAGTTCCTCGATGGTCA	56	176
135	CMTmC17	CCCGTGGGATATCATTAGATAAG	AATATGTCCCTGCCTGGGTA	57	100
136	CMTmC16	TTATAAGAATGATGTTACTCGAT	CATCATCATACATCTTACATTG	60	105
137	CMTmC11	TTGCAACATTTGACTAAATTCCA	CTCCTCTTCTGCCGATCAGT	56	127
138	CMTmC10	CCCTTACATTCGTCCCTTGT	AATATTGGGCTTCCATACGC	60	121
139	CMTmC6	CACAGATGCCTACTGAAAATGC	TGATCGGCGAGAAGGTATG	60	109
140	CMTmC5	GGACCAAAATCAAACCAGAAACT	CGGGAAATAATTCGGGTTCT	51	93
141	CMTmC3	CATCAGGGGTACTTCCCATT	ACTTCCGGAGGTCAGAAGAC	53	131
142	CMTm260	ACAATGGTTCTTTTGATCCTTGA	TGCAAACAATGTGTGTGTGTG	56	90

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
143	CMTm250	GCCGCTCTATAAAGTACCTCTCTC	GCGATCCCATTCTCAGTTCT	57	138
144	CMTm244	GTAAAAGAGAAGGAATACGG	CAGCTACAAAATAGTTACTGAAC	56	120
145	CMTm240	ACCATTGCCATTTCTGAAGG	TTTGAGTGGGTGCTTGTCAG	59	150
146	CMTm236	TTGTTGACTCTGGCAAATCG	TCGAGTCTTCAGCATTATCAGC	56	121
147	CMTm234	GGTGTCGGAAACGAGATAAGG	CATAAGGGCGCTCAATTTCA	47	193
148	CMTm220	AAGCCAAAGCCCCTTATCT	TTTTTGAAATTCTTTGCATCACT	55	133
149	CMTm212	AACCTAACCCCCAAAACAGC	AAATGCGCAGAAGAATCCAG	60	118
150	CMTm204	GGTCATAATATTTTCAACCCCATC	TTCTCTTACACCAATTTTGTTTGG	50	154
151	CMTm203	GATACCGTTTTTCGAATCAAATC	CAAATTGATAGGAATGTGCAGAG	55	102
152	CMTm202	GGTGCTCAATTACCCCTGCT	CAACCTGACAGGCAAACCAG	60	108
153	CMTm199	GGACACGTATCCGTCACCTT	TTCCCCATCTGCATGTTACTC	55	192
154	CMTm196	TCACGAAAAACCCTAAACC	GTTAACCCAAATCAAAATGGT	58	128
155	CMTm189	AATTATATAGCTGGCTGGATCG	AACATACAACAGCAGGGAATG	56	106
156	CMTm182	AGTTGGCTTTAGCACATGG	GGACATCAGAAGCCACAGT	59	111
157	CMTm164	AGCCTTTCAGAAGAACCAAG	GGCTTCAAACAAATACTAACCA	51	140
158	CMTm162	TGGATGGGGAAATTATTGGA	ATTCAGGGGAGATTGGGACT	56	97
159	PU000104	TCGGATCCACTCCCATAGAC	AAACCATGCCTCTGACAACC	54	233
160	PU000716	TCCGGTAGAGAATCATTCCG	ATCATCCATCATCGACCCAT	58	189

Tên chỉ thị	Trình tự mồi		Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
Tên chỉ thị	Mồi xuôi	Mồi ngược	Nhiệt độ gắn mồi	Kích thước sản phẩm PCR
161	PU001527	CAACTGCTACACCAAGCCAA	GGAGGTGGGGGTAGAGAGAC	46	160
162	PU001748	TGCAATCCATAATTCATAATT TAACC	CACACGACGCTGTGAAAGAT	56	188
163	PU001821	CGGCAGTGATGACTGAGAAA	CGCTACCATGTGGACAGAGA	60	204
164	PU002054	CAACTGCTACACCAAGCCAA	GGAGGTGGGGGTAGAGAGAC	59	164
165	PU002121	ATCGATAAGAAAGACGGCGA	CCTTCAGGTCCGAGTTTCAA	56	199
166	PU002158	GTCGGGGTAGGGAGAAACTC	AGTCGGAACAACGAATCCAC	59	251
167	PU002184	GGGGATGCAAAAAGTGAAAA	CCCCAACAAAATCCCTTCTT	56	124
168	PU002200	GGGCTTCGAGGACATATTGA	GCCGAAAAGCTTTCTCACAC	57	219
169	CMTp84	GCGGTAACAGGTTGTTTGGT	CCATCAGGATACCCTACAAAGG	45	150
170	CMTm8	AGACTAAGTTTTCAGGCAGT	GAACTTGTAAATGATCTATGTTG	55	137-148
171	CMTm12	CATGTTTTCTCATTCACAAGCTG	AGGGCGTTGTTAGGTTTGTG	60	115-123
172	CMTm39	ATCTTTGTGCTTCTAACCTTTTTC	TAAAGCTCGAAAAAGCAACC	57	144-160
173	CMTm96	CGTCCATTTGGAAGCTCAGT	CATCCTCGTTCCTTGAGATCAT	55	101-111
174	CMTm157	GGACAGAGTGGCTAGGTCTGAGT	CCAAACAAGAGATGGGCAGA	59	123-129
175	CMTm177	CAGACGTCGAACGTTGTCAC	CTGGAGAGGAGCATTTGGAG	56	101-115
176	CMTm186	TCCAAATTTCAGGGAAGTGAGT	CCGAGATGAAGAAGGACGAG	56	139-147
177	CMTm190	GCATTGGATAACCTTATTCTG	CTCCTTCGACAGGGAAG	58	102-114
178	CMTm214	TGCTTTGATCAGTGAGCAGT	GGATGTACTCTCCGGACTTTC	47	130-142