Trang chủ / Tài liệu miễn phí / Luận Án Tiến Sĩ Y Học

Tính kháng thuốc oseltamivir của virut cúm A lưu hành tại miền Bắc Việt Nam, 2001 – 2012 - 17


1.2 Thử nghiệm ức chế neuraminidase

1.2.1 Kết quả ban đầu qua máy đọc Victor X2


1 2 2 Giá trị IC 50 của các phân típ vi rút cúm A thông thường Stt A H1N1 nM 1


1.2.2 Giá trị IC50 của các phân típ vi rút cúm A thông thường



Stt

A/H1N1 (nM)

A/H1N1pdm09 (nM)

A/H3N2 (nM)

A/H5N1 (nM)

1

0.16

0.37

0.34

1.3

2

0.37

0.19

0.05

0.13

3

0.24

0.08

0.18

1.2

4

0.35

0.24

0.01

0.3

5

0.21

0.02

0.01

0.56

6

0.34

0.1

0.25

0.94

7

0.4

0.13

0.52

0.79

8

0.16

0.09

0.31

2.36

9

0.31

0.06

0.11

4.55

10

0.2

0.12

0.08

1.75

11

0.48

0.09

0.07

4.16

12

1.03

0.12

0.18

1.83

13

0.25

0.11

0.17

7.27

14

0.4

0.06

0.04

7.3

15

0.26

0.29

0.04

3.41

16

0.33

0.45

0.24

8.98

17

0.45

0.05

0.02

2.65

18

0.45

0.32

0.05

6.3

19

0.12

0.16

0.07

0.45

20

0.13

0.29

0.35

3.65

21

0.33

0.08

0.99

2.01

22

0.64

0.12

0.02


23

0.25

0.15

0.07


24

0.96

0.07

0.59


25

1.18

0.14

0.27


26

1.03

0.18

0.04


27

1.35

0.21

0.22


28


0.1

0.24


29


0.12

0.53


30


0.17

0.39


31


0.12

0.18


32


0.1

0.31


33


1.51

0.02


34


0.17

0.20


35


0.09

0.03


Có thể bạn quan tâm!

Xem toàn bộ 147 trang tài liệu này.

1.2.3 Biểu đồ thể hiện mức độ kháng thuốc của vi rút bằng phần mềm JASPR


A/H1N1





A/H1N1pdm09



A/H3N2



A/H5N1



Chủng chứng




2. Các vị trí đột biến trên protein NA chủng A/H1N1, A/H1N1pdm09 và A/H5N1 được xác định sau khi giải trình tự gen của các chủng vi rút trong nghiên cứu


Vi-rút cúm A/H1N1

Tên chủng

Đột biến trên protein NA (Vị trí axit amin*)

Q137K

Y156H

I223V

S247G

H275Y


2008

A/Vietnam/TX285/08

-

-

-

-

A/Vietnam/TB289/08

-

-

-

-

A/Vietnam/TX200/08

-

-

-

-

A/Vietnam/TX233/08

-

-

-

-

A/Vietnam/BT241/08

-

-

-

-

A/Vietnam/LS324/08

-

-

-

-


2009

A/Vietnam/32036/09

-

-

-

-

A/Vietnam/E197/09

-

-

-

-

A/Vietnam/Q271/09

-

-

-

-

A/Vietnam/31808/09

-

-

-

-

A/Vietnam/34381/09

-

-

-

-

A/Vietnam/N116/09

-

-

-

-

Vi rút cúm A/H1N1pdm09


Tên chủng

Đột biến trên protein NA (Vị trí axit amin*)

I223M

I223K

S247N

H275Y

Q313K

vàI427T


2009

A/Vietnam/32023/09

-

-

-

-

A/Vietnam/32043/09

-

-

-

-

A/Vietnam/32047/09

-

-

-

-

A/Vietnam/32060/09

-

-

-

-

A/Vietnam/32067/09

-

-

-

-

A/Vietnam/32081/09

-

-

-

-

A/Vietnam/32085/09

-

-

-

-

A/Vietnam/33419/09

-

-

-

-

2011

A/Vietnam/36530/11

-

-

-

-

Vi rút cúm A/H5N1

Tên chủng

Đột biến trên protein NA (Vị trí axit amin*)




I117V

Q136L

V149A

D199G

S247N

H275Y

N295S

2003

A/Vietnam/UT3030/03

-

-

-

-

-

-

-


2004

A/Vietnam/1203/04

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/1194/04

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/3062/04

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/JP178/04

-

-

-

-

-

-

-


2005

A/Vietnam/JP14/05

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/JP4207/05

-

-

-

-

-

-

-

A/VietNam/HN30408/05

-

-

-

-

-

-


2007

A/Vietnam/HN31203/07

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31209/07

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31242/07

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31244/07

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31312/07

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31323/07

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31239/07

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31388/07

-

-

-

-

-

-

-


2008

A/Vietnam/HN31394/08

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31412/08

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31432M/08

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31413/08

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31461/08

-

-

-

-

-

-

-


2009

A/Vietnam/HN31641/09

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31604/09

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31633/09

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN31673/09

-

-

-

-

-

-

-


2010

A/Vietnam/HN36250/10

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN36282/10

-

-

-

-

-

-

-

A/Vietnam/HN36285/10

-

-

-

-

-

-

-


3. Mã số các trình tự gen mã hóa HA và NA của các chủng vi rút cúm A/H1N1, A/H1N1pdm09 và A/H5N1 trên Ngân hàng dữ liệu DNA NCBI (National Center for Biotechnology Information – US National Library of Medicine)

3.1 Mã số các trình tự gen mã hóa HA và NA của các chủng vi rút cúm A/H1N1


STT

Tên chủng

Mã số đăng ký

Gen HA

Gen NA

1

A/HaNoi/2017/2001

CY103972

CY103974

2

A/HaNoi/2143/2001

CY104686

CY104688

3

A/HaNoi/2253/2001

CY103980

CY103982

4

A/HaNoi/2476/2001

CY103988

CY103990

5

A/HaNoi/2480/2001

CY104694

CY104696

6

A/HaNoi/2532/2001

CY103996

CY103998

7

A/HaNoi/2546/2002

CY104004

CY104006

8

A/HaNoi/2704/2002

CY104012

CY104014

9

A/HaNoi/ARI36/2003

CY104702

CY104704

10

A/HaNoi/BM857/2003

CY105222

CY105224

11

A/HaNoi/BM862/2003

CY105230

CY105232

12

A/HaNoi/BM870/2003

CY104710

CY104712

13

A/HaNoi/BM893/2003

CY104718

CY104720

14

A/HaNoi/BM898/2003

CY104020

CY104022

15

A/HaNoi/BM902/2003

CY104726

CY104728

16

A/HaNoi/BM910/2003

CY104734

CY104736

17

A/HaNoi/BM945/2003

CY104742

CY104744

18

A/HaNoi/BM949/2003

CY104028

CY104030

19

A/HaNoi/BM959/2003

CY104750

CY104752

20

A/HaNoi/BT241/2008

CY104870

CY104872

21

A/HaNoi/HN1004/2003

CY104036

CY104038

22

A/HaNoi/HN1017/2003

CY104758

CY104760

23

A/HaNoi/HN1024/2003

CY104044

CY104046

24

A/HaNoi/HN337/2003

CY104766

CY104768

25

A/HaNoi/Q421/2006

CY105118

CY105120

26

A/HaNoi/Q555/2006

CY104838

CY104840

27

A/HaNoi/Q580/2006

CY104846

CY104848

28

A/HaNoi/Q591/2006

CY104284

CY104286

31

A/HaNoi/N229/2008

CY104292

CY104294

32

A/HaNoi/TX200/2008

CY105134

CY105136

33

A/HaNoi/TX233/2008

CY105142

CY105144


STT

Tên chủng

Mã số đăng ký

Gen HA

Gen NA

1

A/Viet Nam/001-1020/2009

CY128467

CY128469

2

A/Viet Nam/001-1424/2009

CY128435

CY128437

3

A/Viet Nam/001-1716/2009

CY128443

CY128445

4

A/Viet Nam/001-1880/2009

CY128451

CY128453

5

A/Viet Nam/001-1889/2009

CY128459

CY128461

6

A/Viet Nam/001-1890/2009

CY128064

CY128066

7

A/Viet Nam/11032002/2009

CY128371

CY128050

8

A/Viet Nam/11032006/2009

CY128379

CY128381

9

A/Viet Nam/11032010/2009

CY128387

CY128389

10

A/Viet Nam/11032011/2009

CY128054

CY128056

11

A/Viet Nam/11032016/2009

CY128395

CY128397

12

A/Viet Nam/11032017/2009

CY128403

CY128405

13

A/Viet Nam/11032021/2009

CY128411

CY128413

14

A/Viet Nam/12032001/2009

CY128419

CY128421

15

A/Viet Nam/12032005/2009

CY128427

CY128429

16

A/Viet Nam/13032001/2009

CY128131

CY128133

17

A/Viet Nam/13032002/2009

CY128139

CY128141

18

A/Viet Nam/13032008/2009

CY128147

CY128149

19

A/Viet Nam/13032009/2009

CY128155

CY128157

20

A/Viet Nam/13032011/2009

CY128163

CY128165

21

A/Viet Nam/13032015/2009

CY128171

CY128173

22

A/Viet Nam/13032016/2009

CY128179

CY128181

23

A/Viet Nam/13032019/2009

CY128187

CY128189

24

A/Viet Nam/13032030/2009

CY128195

CY128197

25

A/Viet Nam/811/2009

CY128467

CY128085

26

A/Viet Nam/817/2009

CY128435

CY128077

27

A/Viet Nam/818/2009

CY128443

CY128093

28

A/Viet Nam/823/2009

CY128451

CY128109

31

A/Viet Nam/835/2009

CY128459

CY128101

32

A/Viet Nam/841/2009

CY128064

CY128125

33

A/Viet Nam/850/2009

CY128371

CY128117


STT

Tên chủng

Mã số đăng ký

Gen HA

Gen NA

1

A/Vietnam/UT3028/2003

HM114449

HM114451

2

A/Vietnam/UT3030/2003

HM114465

HM114467

3

A/Vietnam/UT3035/2003

HM114473

HM114475

4

A/Viet Nam/1203/2004

EF541403

EF541467

5

A/Viet Nam/3046/2004

AY651335

AY651446

6

A/Viet Nam/JP178/2004

EF456795

EF456796

7

A/Vietnam/1194/2004

EF541402

EF541466

8

A/Vietnam/UT30259/2004

HM114513

HM114515

9

A/Vietnam/UT3040/2004

HM114481

HM114483

10

A/Vietnam/UT3062/2004

HM114505

HM114507

11

A/Viet Nam/HN30408/2005

EF456803

EF456804

12

A/Viet Nam/JP14/2005

EF456799

EF456801

13

A/Viet Nam/JP4207/2005

EF456798

EF456800

14

A/Vietnam/UT30850/2005

HM114537

HM114539

15

A/Viet Nam/HN31242/2007

EU294369

EU294372

16

A/Vietnam/HN31244/2007

HQ215515

HQ215516

17

A/Vietnam/HN31388M1/2007

HM114585

HM114587

18

A/Vietnam/UT31203A/2007

HM114545

HM114547

19

A/Vietnam/UT31239/2007

HM114553

HM114555

20

A/Vietnam/UT31244II/2007

HM114561

HM114563

21

A/Vietnam/UT31312II/2007

HM114577

HM114579

22

A/Vietnam/HN31432M/2008

HM114617

HM114619

23

A/Vietnam/UT31394II/2008

HM114593

HM114595

24

A/Vietnam/UT31412II/2008

HM114601


25

A/Vietnam/UT31413II/2008

HM114609

HM114611

Xem tất cả 147 trang.

Ngày đăng: 12/11/2022
Trang chủ Tài liệu miễn phí